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Muster gründungsprotokoll förderverein

Das genomweite Mediationscan-Verfahren war wie folgt. Betrachten Sie eine eQTL, die unser vorheriger Genomscan bereits gezeigt hat, dass sie die Expression von Gen j beeinflusst. Bezeichnen Sie die Expressionsstufe für j im einzelnen i als und eQTL-Effekt als (diese entsprechen jeweils Y und X in der oben genannten Vermittlungsbeschreibung). Betrachten Sie ferner einen vorgeschlagenen Mediator , wobei der Satz aller berechtigten chromatin zugänglichen Standorte oder exprimierenden Gene ist, und lassen Sie mik der Wert dieses Mediators für den einzelnen i sein. Der Vermittlungsscan für ein bestimmtes Gen/eQTL-Paar j wird durch einen Modellvergleich zwischen dem alternativen Modell (3) und dem Nullmodell durchgeführt, wobei andere Begriffe wie für Eq 2 beschrieben sind. (Nicht, werden zusätzliche Kovariaten angezeigt, z. B. konditionierte Loci, die sowohl in den Null- als auch in den alternativen Modellen enthalten wären.) Der obige Modellvergleich kann als Neubewertung der Bedeutung einer bestimmten eQTL-Assoziation angesehen werden, indem jeder vorgeschlagene Mediator nacheinander konditioniert wird (d. h. die Prüfung von X y| M für jedes M).

Der resultierende Mediationscan, im Gegensatz zu den früher beschriebenen Genomscans, fixiert somit den QTL-Standort, während er im gesamten Genom auf Kandidatenmediatoren getestet wird. In unserer Studie verwenden wir eine empirische Annäherung der oben genannten an genomweite Daten angepasst, aufbauend auf Mediationsanalysen, die in Studien an DO-Mäusen verwendet werden [22, 23, 33]. Im Überblick: Für eine bestimmte eQTL, d.h. eine QTL, für die Schritt (1) (X x Y) eingerichtet wurde, haben wir einen genomweiten Mediationscan durchgeführt. Dieser Vermittlungsscan bestand aus Testschritt (4) (X – Y| M), d.h. zu testen, ob die eQTL-Assoziation bei der Hinzufügung des Mediators als Kovariate für eine große Anzahl von “potenziellen” Mediatoren, nämlich allen Chromatinregionen (oder Transkripten) genomweit, signifikant reduziert wurde. Beachten Sie, dass die meisten dieser potenziellen Mediatoren nach einer herkömmlichen Analyse formal nicht förderfähig wären (d. h. X – M würde nicht halten), aber hier halfen, eine Hintergrundebene (null) der Assoziation zu definieren. Die Ergebnisse des Mediationscans wurden dann gefiltert, um nur Ergebnisse aufzunehmen, die beide der folgenden Kriterien erfüllen: Erstens muss der Mediator eine ko-lokalisierende QTL darstellen, d.

h. eine QTL, für die Schritt (2) (X – M) gilt; zweitens muss die Verbindung zwischen QTL und Mediator stärker sein als die zwischen QTL und Transkript (X – M > X – M), dieser Annäherungsschritt (3) (M – Y| X). Wir haben nicht versucht, zwischen teilweiser und vollständiger Mediation zu unterscheiden, da diese Unterscheidung zu leicht durch Lärm verdeckt wurde. Herkömmliche Zuordnungsregel-Data-Mining-Anwendungen konzentrieren sich auf die Ermittlung von Regeln für hochunterstützte und vertrauensvolle Assoziationen, da diese Regeln für die Klassifizierung verwendet werden können.4,7 Zum Beispiel eine Regel mit hoher Unterstützung und hohem Vertrauen, die besagt, dass junge Männer, die Artikel, a, b und c kaufen, 65 Prozent der Zeit auch artikel d 65 Prozent der Zeit kaufen, verwendet werden können, um eine Marketingstrategie zu konstruieren, in der alle vier Artikel zusammenhängend in einem Regal platziert werden. Die Alliance for Digital Humanities Organizations wird von einem Lenkungsausschuss geleitet, der sich mit der allgemeinen Strategie und Verwaltung der Organisation befasst. Die stimmberechtigten Mitglieder kommen aus jedem der sieben konstituierenden, regionalen Mitglieder der ADHO. Nicht stimmberechtigte Mitglieder sind gewählte Offiziere, Vorsitzende der anderen ADHO-Ausschüsse, die ADHO-nahen Zeitschriftenredakteure und Vorsitzende der Special Interest Groups.